其实在金州水师惨败后，皇太极就得到了代善大军遇到危机的消息，但苦于制海权的丧失，如何能从登莱反攻？
尚可喜也不多做解释，他深知，水师的打造倾注了皇太极大量的心血，如今主力尽殁且是被明军所得，今后金州沿岸恐难有宁日。
于是逃回来后直接前往盛京向皇太极领死，不想皇太极虽然暴怒但还是以尚可喜保住了水师最后的火种为由，赦免了他，仅罚俸两年，取消都元帅封号，降为金州水师将军。
这么轻的处罚，让尚可喜感激的当场老泪纵横，当场砍下自己的一只左手小指，立下誓言要重振金州水师，为大汗夺回制海权！
皇太极其实并非不想杀他，只是后金懂海战的人才寥寥无几，如今水师受到如此重创，再杀了自己的大将，又有何用？不如宽宥尚可喜，准其戴罪立功，又落下贤明仁厚的美名，何乐而不为？
但援救代善的工作，令皇太极夜不能寐，代善作为四大贝勒之首，对皇太极忠心耿耿，最难能可贵的是，代善指挥作战极为老道，是大金少数智谋卓越的帅才，因此皇太极下令不惜一切代价援救它！
在众大臣的建议下，皇太极一面命人向山海关作出佯攻的态势，逼迫山海关方向的明军不敢南下夹击代善，另一方面让山西的范永斗等汉奸商人，大肆向关隘守军将领渗透，让代善能不费吹灰之力地破关而出，重新返回盛京。
当他在盛京见到了像苍老了十岁的大哥代善，又听闻他让自己的儿子断后，惨死于乱军之中的消息后，两兄弟只是抱头痛哭，令在场众人无不落泪。
不过后来看到代善带回的如此海量的人口物资，皇太极觉得这趟南征依然是大获全胜的！
因为虽然回来的部队中，就是正红旗损失较大比较麻烦，其他损失的汉军部队有了这么多包衣后，要组建多少没有？
他当场就将最新捕捉来的生女真两千多人充实给正红旗，同时将孔有德的天佑军恢复建制，多造大炮，进一步充实火器部队的实力。
听闻耿仲明、巴布泰被赵信活捉，他打算派出使者去京师赎回，堂堂九贝勒被活捉，不赎回来太丢人了。
当日夜里，皇太极在宫中给南征回来的代善等人设宴压惊，代善和孔有德等人均表示赵家军战力之强，战斗意志之坚决，均为明军各支部队的翘首，万万不可让赵家军崛起，否则大金将永无宁日。
代善尤为动容的表示，“明朝原来的优势只在于火器，如今大金也有相同甚至更优之火器部队，已经不足虑也！但赵家军却能在火力兵力均处于劣势之下，依然视死如归向我军频频发起敢死逆袭，这实在太可怕了！”
“若明军人人如此，大金何日能入主中原？”
皇太极等人对代善的话深信不疑，因为代善向来敢战能战，他都能吃如此大亏，足见此人不一般。
范文程提出，赵信此人，可以一边试着诱降，如若不成，则务必加快入关步伐，因为只有入关后，八旗的铁蹄才能对赵家军进行威胁，只要乘其还未壮大，一举灭之，大金依然胜算极大。
宁完我分析，当下俘虏抓回来如此之多，原有的农奴制度已经无法胜任，需要进行改制，提升官僚机构的运作效力，最大限度的挖掘大金的战争潜力，为入关做好制度上的准备。
经过讨论到深夜，皇太极终于作出了重大决定，后金仿明廷（其实他自己想也想不出来），设置六部，对八旗尤其是汉军部队的建制作了进一步的细化和明确。
任命议政和硕礼亲王代善总理六部，六部长官之首为承政，参与行政事务决策。
具体为：
吏部承政，爱新觉罗·代善（兼）